Sonic hedgehog (SHH) merupakan ligand pada vertebrate pathway, Peran sonic hedgehog sebagai ligand yang akan mengaktifkan transkripsi melalui jalur SMO, sedangkan aktivitas microglia dapat melalui jalur cytokine atau dari M-SCF, dengan kata lain sonic hedgehog tidak secara langsung mengaktifkan microglia, walaupun peran
dalam perkembangan otak sudah banyak diketahui.
