Abstract. Sexually transmitted diseases are diseases that are transmitted through sexual contact, but can also be transmitted from mother to fetus in the womb, blood transfusion. This study aims to determine differences in the level of knowledge about sexually transmitted diseases in students at SMAN 1 Bongas and Madrasah Aliyah Darul Falah Islamic Boarding School. This study uses a purposive sampling method with a cross sectional design. This data is primary data by providing a validated questionnaire. The total sample in this study was 90 people. The distribution of the level of knowledge of sexually transmitted diseases in SMAN 1 Bongas obtained results based on good categories with a percentage of 13.3%, enough categories with a percentage of 71.1% and less categories with a percentage of 15.6%. Whereas in the Darul Falah Islamic Boarding School, the results were obtained by good category with a percentage of 20.0%, a sufficient category with a percentage of 80.0% and there was no less category. The average value of knowledge level of sexually transmitted diseases is greater in students of Darul Falah Islamic School Madrasah compared to SMAN 1 Bongas with a difference of 8.3 (p-value = 0.004).Keywords: Students, Knowledge, Sexually Transmitted DiseasesAbstrak. Penyakit Menular Seksual adalah penyakit yang ditularkan melalui hubungan seksual, selain itu juga dapat ditularkan dari ibu ke janin dalam kandungan, transfusi darah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan tingkat pengetahuan tentang penyakit menular seksual pada pelajar SMAN 1 Bongas dan Madrasah Aliyah Pesantren Darul Falah. Penelitian ini menggunakan metode purposive sampling dengan rancangan cross sectional. Data ini merupakan data primer dengan memberikan kuesioner yang sudah divalidasi. Total sampel pada penelitian ini adalah 90 orang. Distribusi tingkat pengetahuan penyakit menular seksual di SMAN 1 Bongas didapatkan hasil berdasarkan kategori baik dengan persentase 13,3%, kategori cukup dengan persentase 71,1% dan kategori kurang dengan persentase 15,6%. Sedangkan pada Madrasah Aliyah Pesantren Darul Falah didapatkan hasil berdasarkan kategori baik dengan persentase 20,0%, kategori cukup dengan persentase 80,0% dan tidak terdapat kategori kurang. Nilai rata-rata pengetahuan tentang penyakit menular seksual lebih besar pada siswa Madrasah Aliyah Pesanten Darul Falah dibandingkan dengan SMAN 1 Bongas dengan selisih 8.3 (p-value=0.004).Kata Kunci: Pelajar, Pengetahuan, Penyakit Menular Seksual