Telah dilakukan penelitian mengenai isolasi dan identifikasi senyawa flavonoid dari tumbuhan lamun (Cymodocea rotundata Ehrenberg & Hemprich ex Ascherson). Ekstraksi dilakukan dengan metode maserasi (etanol 95%) dengan rendemen ekstrak sebesar 17,29% menghasilkan ekstrak kental sebanyak 121 gram. Fraksinasi dilakukan dengan metode ekstraksi cair-cair menggunakan pelarut n-heksan, etil asetat, dan air. Terhadap fraksi etil asetat dilakukan subfraksinasi dengan kromatografi cair vakum dengan sistem elusi landaian. Dilanjutkan dengan pemurnian menggunakan KLT preparatif dengan fase diam silika gel GF254 dan fase gerak n-heksan : etil asetat (6:4) hingga diperoleh isolat. Isolat dilakukan karakterisasi dengan spektrofotometri ultra ungu - sinar tampak yang menunjukkan 2 puncak serapan pada panjang gelombang 275 nm dan 327 nm. Karakterisasi dilanjutkan dengan menggunakan pereaksi geser NaOH. Berdasarkan karakterisasi isolat, maka dapat disimpulkan bahwa isolat adalah senyawa flavonoid golongan isoflavon.