Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bagaimana pengaruh Audit Rotation dan Audit Tenure terhadap Kualitas Audit dengan Fee Audit sebagai variabel pemoderasi pada perusahaan manufaktur yang terdaftar di BEI tahun 2012-2014. Metode penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode kuantitatif. Sampel dalam penelitian adalah 46 perusahaan manufaktur yang telah memenuhi kriteria sampel selama tahun 2012-2014 dengan metode purposive sampling. Teknik analisis yang digunakan adalah regresi logistik dengan SPSS 21.0. Hasil penelitian ini secara parsial menunjukkan bahwa variabel audit rotation berpengaruh negatif tidak signifikan terhadap kualitas audit, variabel audit tenure berpengaruh negatif tidak signifikan terhadap kualitas audit, variabel fee audit berpengaruh positif dan signifikan terhadap kualitas audit, interaksi antara audit rotation dan fee audit berpengaruh positif dan signifikan terhadap kualitas audit, interaksi antara audit tenure dan fee audit berpengaruh positif dan signifikan terhadap kualitas audit. Hasil penelitian secara simultan menunjukan bahwa Audit Rotation dan Audit Tenure berpengaruh positif dan signifikan terhadap Kualitas Audit dengan fee audit sebagai variabel pemoderasi.